Secuenciación molecular

Tercera generación

Test online

Test 4 sobre secuenciación de ácidos nucleicos: secuenciación de tercera generación.

Conocimientos requeridos:

Tecnología PacBio (Pacific Biosciences).
Tecnología Nanopore (Oxford Nanopore).

Tests relacionados:

Pregunta 1

Significado de las siglas SMRT:

Single molecule reverse transcription.

Small molecule reverse transcription.

Single molecule real time.

Pregunta 2

Secuenciación SMRT:

Se basa en la secuenciación de una única molécula de ADN.

Requiere amplificación clonal del ADN.

El método de Maxam y Gilbert es secuenciación SMRT.

Pregunta 3

Secuenciación SMRT:

Tecnología PacBio.

Tecnología Illumina.

Ambas respuestas.

Pregunta 4

Se basa en cambios de conductividad eléctrica:

Tecnología PacBio.

Tecnología Nanopore.

Ambas respuestas.

Pregunta 5

Utiliza dNTP marcados con fluoróforos distintos:

Tecnología PacBio.

Tecnología Nanopore.

Ambas respuestas.

Pregunta 6

Tecnología PacBio:

Al igual que en Sanger automático y en Illumina, el fluoróforo se sitúa en la base.

A diferencia de Sanger automático y de Illumina, el fluoróforo se sitúa en el grupo fosfato.

Esta tecnología no utiliza fluoróforos.

Pregunta 7

Tecnología PacBio:

El fluoróforo queda en el ADN tras la incorporación del dNTP.

El fluoróforo se elimina en el PPi tras la incorporación del dNTP.

Esta tecnología no utiliza fluoróforos.

Pregunta 8

Guía de ondas en modo cero (ZMW):

Estructura nanofotónica que reduce el campo óptico debido al comportamiento de la luz al atravesar una apertura pequeña.

En ella se dispone un complejo formado por una ADN polimerasa unida al ADN.

Ambas respuestas.

Pregunta 9

Tecnología PacBio:

Es un método de síntesis.

Es un método de lectura directa.

Es un método de terminación reversible.

Pregunta 10

Tecnología PacBio:

La lectura se realiza cuando el fluoróforo se desprende del ddNTP.

La lectura se realiza cuando el dNTP se incorpora la cadena.

La lectura se realiza después de la síntesis de toda la cadena.

Pregunta 11

Tamaño máximo de lectura en la tecnología PacBio:

30 kb.

200 kb.

300 pb.

Pregunta 12

Tecnología PacBio:

Se utilizan adaptadores con estructura de horquilla en ambos extremos del fragmento.

Se utilizan adaptadores con estructura de horquilla en 3 ' y con estructura lineal en 5 ' del fragmento.

Se utilizan adaptadores con estructura lineal en ambos extremos del fragmento.

Pregunta 13

Tecnología PacBio:

El primer hibrida con el adaptador.

La ADN polimerasa tiene biotina para poder captar el complejo en ZMW con estreptavidina.

Ambas respuestas.

Pregunta 14

Tecnología Nanopore:

El ADNss se coloca en el interior de nanoporos donde tiene lugar la polimerización.

El ADNss atraviesa nanoporos de naturaleza proteica sobre una membrana conductora.

Se sintetiza una ADNds a partir de dNTP marcados con fluoróforos.

Pregunta 15

Tecnología Nanopore:

El ADNds atraviesa los nanoporos.

El ADNss atraviesa los nanoporos.

El ADNds se ancla a los nanoporos.

Pregunta 16

Tecnología Nanopore:

La enzima alfa hemolisina facilita el paso del ADNss a través del nanoporo.

La alfa hemolisina es un nanoporo de una bacteria que causa la lisis de los hematíes.

Ninguna de las anteriores.

Pregunta 17

Tecnología Nanopore:

Permite la secuenciación de ADN.

Permite la secuenciación de ARN.

Permite la secuenciación de ADN y ARN.

Pregunta 18

Tecnología Nanopore:

Cada base produce un cambio de potencial en la membrana.

La corriente eléctrica es producida por la conducción de iones a través del poro al aplicar un voltaje.

Ambas respuestas.

Pregunta 19

Tecnología Nanopore:

Los nanoporos se denominan ZMW.

Es un método de síntesis.

Aunque se parte de ADNds, sólo el ADNss atraviesa el nanoporo.

Pregunta 20

Requiere una fase previa de amplificación clonal:

Tecnología PacBio.

Tecnología Nanopore.

Ninguna de las anteriores.

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